Авиаэкспертам из Франции, Египта, России и США удалось восстановить картину произошедшего, собрав в ангаре Каира уцелевшие фрагменты самолета. Установлено, что эпицентр взрыва находился на полу отсека для негабаритного груза. Взрыв произошел на 22 минуте полета, когда лайнер набрал высоту в 10,2 тысячи метров.
Предполагается, что бомбу в хвостовой отсек доставил один из пособников террористов, так как закладка негабаритного груза происходит вручную. В содействии виновникам произошедшего подозревается обслуживающий персонал аэропорта Шарм-Эль-Шейха, проводивший закладку багажа на борт лайнера А321 компании «Кагалымавиа».